开发Sweave文档的建议

2018-06-08 22:19:39

我期待简化我的Sweave文档创建，并且我想听听人们目前的设置。我觉得圣杯就像这样：

在屏幕的一半上编辑Rnw代码

单键绑定编译Sweave文档并运行pdflatex

在屏幕的另一半上查看PDF; 一旦编译完成，PDF就会刷新并集中在正在编辑的文档部分

如果编译有错误，请将PDF替换为编译结果（例如胶乳错误或Sweave错误）

我猜/希望解决方案是Emacs / ESS的一部分与Emacs配置文件的一些代码和/或一个不错的Makefile的组合。但我真的很想听听每个人创建Sweave和/或Latex文档的首选方式。

我谈到的其他一些R用户使用“每个项目一个目录”的设置和一个简单的Makefile。正如你怀疑的那样，Emacs / ESS可以很好地工作。

我倾向于调用一个简单的shell脚本sweave ，这是我在添加'R CMD Sweave'之前编写的（因为我发现重新创建或复制Makefile不吸引人，YMMV）。我也使用Emacs和一个自动刷新的PDF查看器（如okular或kpdf ）。 Emacs23也可以直接预览PDF文件，但我还没有将工作流程切换到该文件。

edd@ron:~$ cat bin/sweave
#!/bin/bash -e

function errorexit () {
    echo "Error: $1"
    exit 1
}

function filetest () {
    if [ ! -f $1 ]; then
       errorexit "File $1 not found"
    fi
    return 0
}


if [ "$#" -lt 1 ]; then
    errorexit "Need to specify argument file"
fi


BASENAME=$(basename $1 .Rnw)

RNWFILE=$BASENAME.Rnw
filetest $RNWFILE
echo "library(tools); Sweave("$RNWFILE")" 
      | R --no-save --no-restore --slave

LATEXFILE=$BASENAME.tex
filetest $LATEXFILE && pdflatex $LATEXFILE

您可以使用Eclipse的StatET插件来完成您提出的所有任务。这就是我用于Sweave开发的原因; 它非常了解latex和R，包括语法高亮等。

你可以在这里找到它：http://www.walware.de/goto/statet。

Longhow Lam已经写了一个很好的指南：http://www.splusbook.com/Rintro/R_Eclipse_StatET.pdf。

http://www.statalgo.com/?p=93

我在OS X上使用TeXShop生成所有的LaTeX和Sweave报告。对我来说，一个新的编译流水线就像添加一个名为Sweave.engine的文件到~/Library/TeXShop/Engines/那样简单，它包含以下内容：

#!/usr/bin/env Rscript
args <- commandArgs(T)

fname <- strsplit(args[1],'.')[[1]][2]

Sweave(paste(fname,'Rnw',sep='.'))

system(paste('pdflatex',paste(fname,'tex',sep='.')))

Sweave现在是一种在TeXShop中编译文档的可选方法。通过将以下TeX hash-bang添加到文件的顶部，我可以将其设置为文档的默认值：

% !TEX TS-program = Sweave

打到Cmd-T将排版文档 - pdf会自动弹出一个单独的窗口。 TeXShop还集成了SyncTeX技术，因此在Rnw源中的Cmd-Click将突出显示PDF窗口中的相应输出，并且PDF窗口中的Cmd-Click将突出显示Rnw源中的相应输入。

TeXShop是mac-only，但基于Qt / poppler的克隆TeXworks可用于Linux，Windows和Mac，并支持许多相同的功能 - 包括TeX hash-bangs和SyncTeX。 TeXworks已经达到了成熟的程度，它被包含在用于Windows的MikTeX软件包2.8版中。

链接地址: http://www.djcxy.com/p/26905.html

上一篇: Recommendations for developing Sweave documents

下一篇: How to get information about error from HttpContext in WCF services