R CMD Sweave究竟是什么？
我在R 2.14的变化中注意到这一点：
R CMD Sweave现在有一个--pdf选项来生成已处理的Sweave文档的PDF版本。
尝试一下，我注意到它不仅在生成的tex上运行pdfLaTeX，而且还正确地包含了bibTeX引用并在之后进行了清理。 看起来像现在使用Sweave的非常好的方式（更不用说现在在编辑器中实现整个例程是多么容易）。
但是现在究竟是什么运行？ 我找不到更多的细节。 看起来Sweave - > pdflatex - > bibtex - > pdflatex - >至少包含pdflatex？
感谢您的问题。 我对自己关于“自动化”过程背后的代码感到怀疑。
R CMD Sweave --pdf最终调用tools::texi2dvi ，其中：
运行[s] latex和bibtex，直到解决所有交叉引用并创建[s] dvi或PDF文件。
（请参阅这里了解更多texi2dvi详细信息）。
以下是由R CMD Sweave --pdf调用设置为运动的一系列事件：
源文件rcmdfn.c代码指示R CMD Sweave通过Rterm.exe运行utils:::.Sweave() --args" 。
如果设置了--pdf ， utils:::.Sweave()调用tools::texi2pdf()来处理Sweave文件。
texi2pdf()反过来调用tools::texi2dvi() 。
最后， texi2dvi()查看环境以了解哪些工具可用，以及上面链接的帮助文件中描述的工作。
您可以尝试手动执行从Rnw到pdf的转换，查看需要多少次才能获得与R CMD Sweave相同的结果。
我对内饰工作知之甚少，但我知道RStudio的开发版本可以让您在knitr和Sweave之间以及在pdflatex和xelatex之间进行选择，并且可以选择bibtex 。