从Windows bash中形成的文本文件中读取内容

2018-06-09 17:47:00

这个问题在这里已经有了答案：

如何连接Bash中的字符串变量27个答案

这听起来像你的id_numbers.txt文件具有DOS / Windows风格的行结束符（回车符后面是换行字符），而不是普通的unix行结束符（只是换行符）。结果是， read认为该行以回车结束， $line实际上在最后有一个回车符，并且嵌入在url中，导致各种混淆。

有几种方法可以解决这个问题。当你使用它时，你可以使用bash修改变量的回车符：

url="http://www.rcsb.org/pdb/files/${line%$'r'}.pdb"

或者你可以有read的告诉它回车计为空白（修剪read将削减领先，并从它读取尾随空白）：

while IFS=$'r' read line

或者你可以使用像dos2unix这样的命令（或者你的操作系统上的任何等效命令）来转换id_numbers.txt文件。

-e echo选项用于在不插入新行的情况下输出所需内容，在此不需要。

另外我怀疑你的文件包含的ID是畸形的，你在哪个操作系统上创建了它？

无论如何，你可以这样简化你的脚本：

!/bin/bash

while read line
do
    wget "http://www.rcsb.org/pdb/files/$line.pdb"
done < id_numbers.txt

我能够用id_numbers.txt生成的id_numbers.txt文件成功测试它：

for i in $(0 9) ; do echo "$i" >> id_numbers.txt ; done

尝试这个：

url="http://www.rcsb.org/pdb/files/"$line
$url=$url".pdb"

有关更多信息，请查看如何连接Bash中的字符串变量？

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