使用变量指定ggpairs图的颜色,但不绘制该变量
我有一个来自世界银行的数据集,有一些连续的和分类的变量。
> head(nationsCombImputed)
iso3c iso2c country year.x life_expect population birth_rate neonat_mortal_rate region
1 ABW AW Aruba 2014 75.45 103441 10.1 2.4 Latin America & Caribbean
2 AFG AF Afghanistan 2014 60.37 31627506 34.2 36.1 South Asia
3 AGO AO Angola 2014 52.27 24227524 45.5 49.6 Sub-Saharan Africa
4 ALB AL Albania 2014 77.83 2893654 13.4 6.5 Europe & Central Asia
5 AND AD Andorra 2014 70.07 72786 20.9 1.5 Europe & Central Asia
6 ARE AE United Arab Emirates 2014 77.37 9086139 10.8 3.6 Middle East & North Africa
income gdp_percap.x log_pop
1 High income 47008.83 5.014693
2 Low income 1942.48 7.500065
3 Lower middle income 7327.38 7.384309
4 Upper middle income 11307.55 6.461447
5 High income 30482.64 4.862048
6 High income 67239.00 6.958379
我希望使用ggpairs在散点图中绘制一些连续变量(life_expect,birth_rate,neonat_mortal_rate,gdp_percap.x),但我想使用数据中的区域分类变量对它们着色。 我已经尝试了许多不同的方法,但是如果不包括分类变量,我就不能着色连续变量。
ggpairs(nationsCombImputed[,c(2,5,7,8,9,11)],
title="Scatterplot of Variables",
mapping = ggplot2::aes(color = region),
labeller = "iso2c")
但是我得到这个错误
stop_if_high_cardinality(数据,列,cardinality_threshold)中的错误:列'iso2c'具有比阈值(15)更多的级别(211)。 请删除列或增加'cardinality_threshold'参数。 增加cardinality_threshold可能会产生很长的处理时间
最终,我只想使用第2列中的iso2c代码,根据区域使用数据点标签对连续变量着色的4x4散点图。
ggpairs有可能吗?
好吧,这是可能的! 根据@Robin Gertenbach的建议,我将列参数添加到我的代码中,这很好,请参阅下文。
ggpairs(nationsCombImputed,
title="Scatterplot of Variables",
columns = c(5,7,8,11),
mapping=ggplot2::aes(colour = region))
我仍然希望使用iso2c列将数据点标签添加到散点图,但是我正在为此付出努力,任何指针都将不胜感激。
正如在注释中,你可以得到ggpairs到的颜色,但不是通过指定列的数字索引你想用绘制绘制维columns = c(5,7,8,11)
为了有一个文本散点图中,您将需要定义的功能,例如textscatter
,你将通过提供lower = list(continuous = textscatter)
在美学中ggpairs函数调用,并指定标签。
textscatter <- function(data, mapping, ...) {
ggplot(data, mapping, ...) + geom_text()
}
ggpairs(
nationsCombImputed,
title="Scatterplot of Variables",
columns = c(5,7,8,11),
mapping=ggplot2::aes(colour = region, label = iso2c))
lower = list(continuous = textscatter)
)
当然,您也可以将标签的美学定义放入文本散射中
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