如何为两个变量包含颜色渐变
我的铬1数据集看起来像这样
head(data)
SNP BP P Dataset LD
1 SNP1 541095 0.00529 expression 0.000610863
2 SNP2 541095 0.07897 original 0.066610863
3 SNP3 541133 0.21990 original 0.040534557
4 SNP4 541233 0.47890 expression 0.008216450
5 SNP5 541260 0.39790 original 0.010310200
6 SNP6 541260 0.19210 expression 0.000390915
7 SNP7 541265 0.000001 original 1
7 SNP7 541265 0.00001 expression 1
我想将两个数据集叠加到一个图中，并显示SNP7与其他SNP的LD相关性。
到目前为止，这是我能想到的
Position<-data$BP/1E6
ggplot(data, aes(x=Position, y=-log10(P), color=Dataset, shape=Dataset)) +
geom_point(size=4) + xlim(540101/1E6,1565570/1E6) + ylim(0,10) +
geom_hline(aes(yintercept=7), color="#a50f15")
我无法根据基于LD的渐变颜色对变体进行分组，所以它仅显示两个数据集的一种颜色
ggplot(data, aes(x=Position, y=-log10(P), colour=LD, shape=Dataset)) +
geom_point(size=4) + xlim(540101/1E6,1565570/1E6) + ylim(0,10) +
geom_hline(aes(yintercept=7), color="#a50f15")
是否有可能
1）将原始数据集的颜色更改为红色，并将表达式更改为蓝色
2）根据LD值进行组合
LD values dataset color dataset color
group1 0 to 0.2 original light blue expression light red
group2 0.2 to 0.4 original . expression .
group3 0.4 to 0.6 original . expression .
group4 0.6 to 0.8 original . expression .
group5 0.8 to 1.0 original dark blue expression dark red
非常感谢
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