更高效的R / Sweave / TeXShop工作
我现在已经在我的Mac OS X 10.6机器上正常工作，以便我可以使用Sweave创建体面的LaTeX文档，其中包括R代码片段，输出和LaTeX格式。 不幸的是，我觉得我的工作流程有点笨重和低效：
使用TextWrangler，我在一个.Rnw文件中一起编写了LaTeX代码和R代码（由<< >> = above和@下面的R代码块包围）。
保存更改后，我使用Sweave命令从R调用R的.Rnw文件
Sweave(file="/Users/mymachine/Documents/Assign4.Rnw",
syntax="SweaveSyntaxNoweb")
作为响应，R输出以下消息：
您现在可以在'Assign4.tex'上运行LaTeX
然后，我在R目录中找到.tex文件（Assign4.tex），并将其复制到我的文档~/Documents/其中.Rnw文件所在的文件夹（将所有内容保存在一个位置）。
然后，我在TeXShop中打开.tex文件（例如Assign4.tex）并将其编译为pdf格式。 只有在这个时候，我才能看到我对文档所做的任何更改，看看它是否“看起来不错”。
有没有一种方法可以通过单击一个按钮来编译所有内容？ 具体来说，直接从TextWrangler或TeXShop调用Sweave / R会很好。 我怀疑可能在终端中编写脚本来完成它，但我对终端没有经验。
请让我知道，如果我还能做其他事情来简化或改进我的工作流程。
在TeXShop中使用Gregor Gorjanc的Sweave.sh脚本轻松实现一键式Sweaving。 从http://cran.r-project.org/contrib/extra/scripts/Sweave.sh获取它，并将它放在你的~/Library/TeXShop/bin/文件夹中。
然后将以下文件添加到~/Library/TeXShop/engines/文件夹中：
作为Sweave.engine ：
#!/bin/bash
~/Library/TeXShop/bin/Sweave.sh -ld "$1"
作为SweaveNoClean.engine ：
#!/bin/bash
~/Library/TeXShop/bin/Sweave.sh -nc -ld "$1"
您必须在Sweave.sh和两个引擎文件上设置权限才能执行。
单击Sweave，在添加这些文件后重新启动TeXShop，打开Sweave文档（使用Rnw扩展名），并在文档窗口上方的下拉菜单中将其从LaTeX更改为Sweave或SweaveNoClean。
注意：“Sweave”选项将自行清理，删除LaTeX和Sweave创建的所有额外文件。 如果你的文件被称为myfile.Rnw，这将包括名为myfile.R和myfile.tex的文件。 所以对智者来说一句话：确保你的Rnw文件的基名是唯一的; 那么没有任何意外的事情会被写下来然后被删除。
SweaveNoClean选项不会自行清理。 这可以确保你不会删除任何意想不到的事情; 尽管它仍然可以写入一个名为myfile.tex的文件，如果您将一个myfile.Rnw文件读取出来的话。 这也不会删除已创建的任何图形，以防您希望将它们与完整的排版文档分开。
我为我的Sweave文档使用了以下格式的Makefile ：
pdf: myfile.tex
R CMD texi2pdf myfile.tex
myfile.tex: myfile.Rnw
R CMD Sweave myfile.Rnw
然后，我可以通过运行命令make pdf在Mac OS Terminal中一步建立文档
我相信在Mac OS X中有一种方法可以使它更接近您的单击目标，但这对我来说已经足够了。
在bash shell命令行上：
R CMD Sweave foo.Rnw && pdflatex foo.tex
运行Sweave，如果成功，则继续执行pdflatex。 Out弹出pdf。 如果你在bash Terminal里有这个，那么只需点击箭头把它取回来，然后重新执行。 然后再次。 然后再次。
Makefile解决方案也不错。
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