在Mathematica中实现四叉树
我在Mathematica中实现了一个四叉树。 我是用Mathematica等函数式编程语言进行编码的新手,我想知道是否可以通过更好地使用模式来改进它或使其更加紧凑。
(我知道我可以通过修剪未使用的节点来优化树,并且可能会有更好的数据结构,如用于空间分解的kd树。)
另外,每当添加新点时,我仍然不满意复制整个树/表达式的想法。 但我的理解是,对整个表达式进行操作而不修改这些部分是功能性编程方式。 我很感谢在这方面的任何澄清。
MV
代码
ClearAll[qtMakeNode, qtInsert, insideBox, qtDraw, splitBox, isLeaf, qtbb, qtpt];
(* create a quadtree node *)
qtMakeNode[{{xmin_,ymin_}, {xmax_, ymax_}}] :=
{{}, {}, {}, {}, qtbb[{xmin, ymin}, {xmax, ymax}], {}}
(* is pt inside box? *)
insideBox[pt_, bb_] := If[(pt[[1]] <= bb[[2, 1]]) && (pt[[1]] >= bb[[1, 1]]) &&
(pt[[2]] <= bb[[2, 2]]) && (pt[[2]] >= bb[[1, 2]]),
True, False]
(* split bounding box into 4 children *)
splitBox[{{xmin_,ymin_}, {xmax_, ymax_}}] := {
{{xmin, (ymin+ymax)/2}, {(xmin+xmax)/2, ymax}},
{{xmin, ymin},{(xmin+xmax)/2,(ymin+ymax)/2}},
{{(xmin+xmax)/2, ymin},{xmax, (ymin+ymax)/2}},
{{(xmin+xmax)/2, (ymin+ymax)/2},{xmax, ymax}}
}
(* is node a leaf? *)
isLeaf[qt_] := If[ And @@((# == {})& /@ Join[qt[[1;;4]], {List @@ qt[[6]]}]),True, False]
(*--- insert methods ---*)
(* qtInsert #1 - return input if pt is out of bounds *)
qtInsert[qtree_, pt_] /; !insideBox[pt, List @@ qtree[[5]]]:= qtree
(* qtInsert #2 - if leaf, just add pt to node *)
qtInsert[qtree_, pt_] /; isLeaf[qtree] :=
{qtree[[1]],qtree[[2]],qtree[[3]],qtree[[4]],qtree[[5]], qtpt @@ pt}
(* qtInsert #3 - recursively insert pt *)
qtInsert[qtree_, pt_] :=
Module[{cNodes, currPt},
cNodes = qtree[[1;;4]];
(* child nodes not created? *)
If[And @@ ((# == {})& /@ cNodes),
(* compute child node bounds *)
(* create child nodes with above bounds*)
cNodes = qtMakeNode[#]& /@ splitBox[List @@ qtree[[5]]];
];
(* move curr node pt (if not empty) into child *)
currPt = List @@ qtree[[6]];
If[currPt != {},
cNodes = qtInsert[#, currPt]& /@ cNodes;
];
(* insert new pt into child *)
cNodes = qtInsert[#, pt]& /@ cNodes;
(* return new quadtree *)
{cNodes[[1]],cNodes[[2]], cNodes[[3]], cNodes[[4]], qtree[[5]], {}}
]
(* draw quadtree *)
qtDraw[qt_] := Module[{pts, bboxes},
pts = Cases[qt, _qtpt, Infinity] /. qtpt :> List;
bboxes = Cases[qt, _qtbb, Infinity] /. qtbb :> List;
Graphics[{
EdgeForm[Black],Hue[0.2], Map[Disk[#, 0.01]&, pts],
Hue[0.7],EdgeForm[Red], FaceForm[],(Rectangle @@ #) & /@ bboxes
},
Frame->True
]
]
用法
Clear[qt];
len = 50;
pts = RandomReal[{0, 2}, {len, 2}];
qt = qtMakeNode[{{0.0, 0.0}, {2.0, 2.0}}];
Do[qt = qtInsert[qt, pts[[i]]], {i, 1, len}]
qtDraw[qt]
产量
这是一个更紧凑的版本。 它使用与原始版本相同的数据结构。 函数splitBox
和insideBox
基本上是一样的(只是写法稍有不同)。
不是逐个添加点,而是在开始的框中包含开头的所有点,因此不需要qtInsert
例程。 在每个递归步骤中,包含多个点的框被分割并且点分布在子框上。 这意味着所有具有多个点的节点都是叶子,因此不需要检查。
qtMakeNode[bb_, pts_] := {{}, {}, {}, {}, qtbb @@ bb, pts}
splitBox[bx_] := splitBox[{min_, max_}] := {min + #, max + #}/2 & /@
Tuples[Transpose[{min, max}]]
insideBox[pt_, bb_] := bb[[1, 1]] <= pt[[1]] <= bb[[2, 1]] &&
bb[[1, 2]] <= pt[[2]] <= bb[[2, 2]]
distribute[qtree_] := Which[
Length[qtree[[6]]] == 1,
(* no points in node -> return node unchanged *)
qtree,
Length[qtree[[6]]] == 1,
(* one point in node -> replace head of point with qtpt and return node *)
ReplacePart[qtree, 6 -> qtpt @@ qtree[[6, 1]]],
Length[qtree[[6]]] > 1,
(* multiple points in node -> create sub-nodes and distribute points *)
(* apply distribute to sub-nodes *)
Module[{spl = splitBox[qtree[[5]]], div, newtreelist},
div = Cases[qtree[[6]], a_ /; insideBox[a, #], 1] & /@ spl;
ReplacePart[qtree,
Join[Table[i -> distribute[qtMakeNode[spl[[i]], div[[i]]]], {i, 4}],
{6 -> {}}]]]]
示例(使用qtDraw
的原始版本):
len = 50;
pts = RandomReal[{0, 2}, {len, 2}];
qt = makeTree[qtMakeNode[{{0.0, 0.0}, {2.0, 2.0}}, pts]];
qtDraw[qt]
结果:
我认为你的代码并不像你期望的那样饥饿。 它确实打破和改革名单,但它往往保持大多数的子列表完好无损。
正如其他人指出的那样,使用Hold包装器和/或HoldXXX属性仍然可以做得更好,以便模拟逐个引用的调用。
有关相关数据结构实现的硬核方法,请参阅
http://library.wolfram.com/infocenter/MathSource/7619/
相关的代码在笔记本Hemmecke-final.nb中(因为它实现了由R. Hemmecke和合着者实现的复曲面Groebner基算法)。
我利用Hold ...属性重新实施了一次刺探,但是我并不擅长这一点,并在代码刺穿了我的时候放弃了它(错过了,但是却杀死了我的Mathematica会话)。 相反,我有一个使用未记录的“原始”Mathematica数据类型的实现,该类型是惰性的,因此适用于逐引用行为。
这个结构被称为“expr bag”,因为通用的Mathematica数据结构是“expr”。 它就像一个List,但是(1)它可以在一端增长(虽然不缩小),(2)与其他原始表达类型(例如版本8中的图)一样,它具有可以通过提供的功能访问和/或更改的组件(一个API,可以这么说)。 它的基本“元素”是惰性的,因为它们可以引用ANY表达式(包括包本身),并且可以用我将在下面指出的方式进行操作。
上面的第一项提供了实施Sow / Reap的基础技术。 这是第二个将在下面的代码感兴趣。 最后,我会沿着解释数据结构的方向加入一些评论,因为没有正式的文档。
我将代码与原始代码保持相同的风格,特别是它仍然是一个在线版本(也就是说,元素不需要全部进入,但可以单独添加)。 改了几个名字。 使基本结构类似于
节点(边界框,值,零个或四个子节点)
如果有子节点,则值字段为空。 box和value字段用通常的Mathematica List表达式表示,尽管使用专用的头部并且使其更类似于C结构风格也许是有意义的。 我的确在做一些类似的事情来命名各种访问/设置功能。
有一点需要注意的是,这种原始数据类型消耗的内存开销远远大于例如List。 所以我下面的变体会使用比原来发布的代码更多的内存。 不是渐近地更多,只是一个恒定的因素。 在访问或设置元素值方面,它也需要一个不变的因子,比如一个可比较的C结构。 所以这不是一个神奇的子弹,只是一种行为不应该给予渐近式惊喜的数据类型。
AppendTo[$ContextPath, "Internal`"];
makeQuadTreeNode[bounds_] := Bag[{bounds, {}, {}}]
(*is pt inside box?*)
insideBox[pt_, box_] :=
And @@ Thread[box[[1]] <= (List @@ pt) <= box[[2]]]
(*split bounding box into 4 children*)
splitBox[{{xmin_, ymin_}, {xmax_, ymax_}}] :=
Map[makeQuadTreeNode, {{{xmin, (ymin + ymax)/2}, {(xmin + xmax)/2,
ymax}}, {{xmin,
ymin}, {(xmin + xmax)/2, (ymin + ymax)/2}}, {{(xmin + xmax)/2,
ymin}, {xmax, (ymin + ymax)/2}}, {{(xmin + xmax)/
2, (ymin + ymax)/2}, {xmax, ymax}}}]
bounds[qt_] := BagPart[qt, 1]
value[qt_] := BagPart[qt, 2]
children[qt_] := BagPart[qt, 3]
isLeaf[qt_] := value[qt] =!= {}
isSplit[qt_] := children[qt] =!= {}
emptyNode[qt_] := ! isLeaf[qt] && ! isSplit[qt]
(*qtInsert #1-return input if pt is out of bounds*)
qtInsert[qtree_, pt_] /; ! insideBox[pt, bounds[qtree]] := qtree
(*qtInsert #2-empty node (no value,no children)*)
qtInsert[qtree_, pt_] /; emptyNode[qtree] := value[qtree] = pt
(*qtInsert #2-currently a leaf (has a value and no children)*)
qtInsert[qtree_, pt_] /; isLeaf[qtree] := Module[
{kids = splitBox[bounds[qtree]], currval = value[qtree]},
value[qtree] = {};
children[qtree] = kids;
Map[(qtInsert[#, currval]; qtInsert[#, pt]) &, kids];
]
(*qtInsert #4-not a leaf and has children*)
qtInsert[qtree_, pt_] := Map[qtInsert[#, pt] &, children[qtree]];
getBoxes[ee_Bag] :=
Join[{bounds[ee]}, Flatten[Map[getBoxes, children[ee]], 1]]
getPoints[ee_Bag] :=
Join[{value[ee]}, Flatten[Map[getPoints, children[ee]], 1]]
qtDraw[qt_] := Module[
{pts, bboxes},
pts = getPoints[qt] /. {} :> Sequence[];
bboxes = getBoxes[qt];
Graphics[{EdgeForm[Black], Hue[0.2], Map[Disk[#, 0.01] &, pts],
Hue[0.7], EdgeForm[Red],
FaceForm[], (Rectangle @@ #) & /@ bboxes}, Frame -> True]]
这是一个例子。 我会注意到缩放是合理的。 也许O(n log(n))左右。 肯定比O(n ^ 2)好。
len = 4000;
pts = RandomReal[{0, 2}, {len, 2}];
qt = makeQuadTreeNode[{{0.0, 0.0}, {2.0, 2.0}}];
Timing[Do[qtInsert[qt, pts[[i]]], {i, 1, len}]]
{1.6, Null}
一般expr袋子笔记。 这些都是旧的,所以我并不认为这一切仍然按照指示进行。
这些功能位于内部环境中。
包创建一个expr包,可选带有预设元素。
BagPart获得expr包的部分,与普通exprs类似。 也可以在lhs上使用,例如重置一个值。
StuffBag将元素附加到包的结尾。
我们也有一个BagLength。 用于遍历一个包。
由于两个原因,这些功能非常有用。
首先,这是在Mathematica中创建可扩展表的好方法。
其次,评估袋子的内容,然后放入原始表格中,因此被屏蔽。 因此,可以将它们用作“指针”(以C语言的形式)而不是对象,而且这不需要等待。以下是一些示例:
a = {1,2,a} (* gives infinite recursion *)
如果我们改用袋子,我们会得到一个自我指涉的结构。
In[1]:= AppendTo[$ContextPath, "Internal`"];
In[2]:= a = Bag[{1,2,a}]
Out[2]= Bag[<3>]
In[3]:= expr1 = BagPart[a, All]
Out[3]= {1, 2, Bag[<3>]}
In[4]:= expr2 = BagPart[BagPart[a, 3], All]
Out[4]= {1, 2, Bag[<3>]}
In[5]:= expr1 === expr2
Out[5]= True
这在Mathematica中很难以其他方式效仿。 人们需要使用稀疏表(哈希)以某种不太透明的方式。
这是一个相关的例子,没有完全调试。 我们基本上实现了一个链接列表,从而可以破坏性地修改尾部,替换子列表等。
tail[ll_] := BagPart[ll,2]
settail[ll_, ll2_] := BagPart[ll,2] = ll2
contents[ll_] := BagPart[ll,1]
setcontents[ll_, elem_] := BagPart[ll,1] = elem
createlinkedlist[elems__] := Module[
{result, elist={elems}, prev, el},
result = Bag[{elist[[1]],Bag[]}];
prev = result;
Do [el = Bag[{elist[[j]],Bag[]}];
settail[prev, el];
prev = el,
{j,2,Length[elist]}];
result
]
In[18]:= tt = createlinkedlist[vv,ww,xx]
Out[18]= Bag[<2>]
In[20]:= BagPart[tt,All]
Out[20]= {vv, Bag[<2>]}
所以tt是一个链表,第一个元素是vv,下一个本身就是一个链表,等等。我没有使用Lisp术语(car / cdr等),因为我无法回想起Lisp的列表操作是否具有破坏性。 但你得到了一般想法。
沿着类似的路线,我使用了expr袋来实现二叉树。 这很有用,因为我们可以在不断的时间内做出破坏性的改变(假设我们已经在插入/删除的位置有一个“处理”),而且expr包的“原始”性质意味着我们完全避免了Mathematica的无限评估语义。
也许另一个应用程序。
Pointer = Internal`Bag
Contents[aa_Pointer, j_Integer] /;0<j<=Internal`BagLength[aa] :=
Internal`BagPart[aa,j]
SetContents[aa_Pointer, j_Integer, e_] /; 0<j<=Internal`BagLength[aa] :=
Internal`BagPart[aa,j] = e
SetContents[aa_Pointer, j_Integer, e_] /; j>BagLength[aa] :=
(Do[Internal`StuffBag[aa,Null], {k,Internal`BagLength[aa]+1,j-1}];
Internal`StuffBag[aa,e])
尝试
a = Bag[{1,2,a,6,t,y,99,Bag[{a,q,3,r,a,5,t}]}]
expr1 = BagPart[a, All]
expr2 = BagPart[BagPart[a, 3], All]
Contents[a, 4]
SetContents[a, 7, Contents[a,7]+5]
SetContents[a,11,33]
Daniel Lichtblau Wolfram Research
这可能不是你想要做的,但Nearest []可以创建一个NearestFunction [],它是一个内置的四叉树结构。
链接地址: http://www.djcxy.com/p/35523.html