Python熊猫到R数据框
我将在Python中将Python熊猫数据框转换为数据框。我发现这个问题很少有库
http://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/r_interface.html
这是rpy2
但我找不到保存或转移到R的方法。
首先我试着“to_csv”
df_R = com.convert_to_r_dataframe(df_total)
df_R.to_csv(direc+"/qap/detail_summary_R/"+"distance_"+str(gp_num)+".csv",sep = ",")
但它给了我一个错误
"AttributeError: 'DataFrame' object has no attribute 'to_csv' "
所以我试图看到它的数据类型
<class 'rpy2.robjects.vectors.DataFrame'>
我怎么能把这个类型的对象保存到csv文件或传输到R？
rpy2.robjects.vectors.DataFrame类型的rpy2.robjects.vectors.DataFrame有一个方法to_csvfile ，而不是to_csv ：http: to_csv
如果想要在Python和R之间传递数据，那么比写入和读取CSV文件更有效。 尝试转换系统：
from rpy2.robjects import pandas2ri
pandas2ri.activate()
from rpy2.robjects.packages import importr
base = importr('base')
# call an R function on a Pandas DataFrame
base.summary(my_pandas_dataframe)
获得data.frame后，可以使用write.table或后者的其中一个包装来保存它，例如writee.csv 。
在rpy2中：
import rpy2.robjects as robjects
## get a reference to the R function
write_csv = robjects.r('write.csv')
## save
write_csv(df_R,'filename.csv')
现在我推荐使用羽毛，这是一种基于Apache Arrow的序列化格式。 它由RStudio / ggplot2 / etc（Hadley Wickham）和pandas（Wes McKinney）的创建者为Python和R之间的性能和互操作性而明确开发（请参见此处）。
您需要大熊猫VERSON 0.20.0+， pip install feather-format ，那么你可以使用to_feather / read_feather操作作为直接替代了to_csv / read_csv ：
df_R.to_feather('filename.feather')
df_R = pd.read_feather('filename.feather')
R等价物（使用包feather ）是
df <- feather::read_feather('filename.feather')
feather::write_feather(df, 'filename.feather')
除了一些小的调整（例如，你不能保存自定义的DataFrame索引，所以你需要先调用df.reset_index() ），这是一个快速简单的替代csv ， pickle等的替代品。
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