标准化每行data.table

这似乎应该很容易,但我找不到答案:(我试图规范每一行data_table像这样:

normalize <- function(x) {
  s = sum(x)
  if (s>0) {
    return(x/s)
  } else {
    return 0
  }
}

如何在data.table的每一行调用这个函数并获得一个标准化的data.table? 我可以做一个for循环,但这肯定不是正确的方法,并且根据我的理解, apply(data, 1, normalize)将会将我的data.table转换为矩阵,这将是一个很大的性能影响。


这是避免强制转换为矩阵的一种方法:

cols = names(DT)
DT[, s := Reduce("+",.SD)]
DT[s > 0, (cols) := lapply(.SD,"/",s), .SDcols = cols]
DT[s <=  0, (cols) := 0]
DT[, s := NULL]

如果有充分的理由在矩阵上使用data.table(在后面的步骤中),我会这样做。


考虑到这个示例数据集(下次请自己提供一个示例数据集)

set.seed(123) 
DT <- data.table(x = rnorm(10), y = rnorm(10), z = rnorm(10))

我会尝试避免行操作,并使用rowSums进行rowSums ,如下所示

DT[, names(DT) := {temp = rowSums(.SD) ; (.SD / temp) * (temp > 0)}]
DT
#              x          y          z
#  1:  0.0000000  0.0000000  0.0000000
#  2:  0.0000000  0.0000000  0.0000000
#  3:  1.6697906  0.4293327 -1.0991233
#  4:  0.0000000  0.0000000  0.0000000
#  5:  0.0000000  0.0000000  0.0000000
#  6:  0.9447911  0.9843707 -0.9291618
#  7:  0.2565558  0.2771142  0.4663301
#  8:  0.0000000  0.0000000  0.0000000
#  9:  0.0000000  0.0000000  0.0000000
# 10: -1.3289000 -1.4097961  3.7386962

我创建temp的原因是为了避免运行rowSums(.SD)两次。 *(temp > 0)部分基本上是你的ifelse语句。 它返回TRUE/FALSE的逻辑向量,然后转换为1/0 ,然后乘以(.SD/temp)


这是我想出来的。 首先你需要编辑你的函数(我相信),以便它返回rep(0, length(x))而不是0

set.seed(123); DT <- data.table(x=rnorm(1e3), y=rnorm(1e3), z=rnorm(1e3))
> DT
                x           y          z
   1: -0.56047565 -0.99579872 -0.5116037
   2: -0.23017749 -1.03995504  0.2369379
   3:  1.55870831 -0.01798024 -0.5415892
   4:  0.07050839 -0.13217513  1.2192276
   5:  0.12928774 -2.54934277  0.1741359
  ---                                   
 996: -0.08997520  0.07664366  1.0609662
 997:  1.07051604  0.25516476 -0.4455056
 998: -1.35110039  0.27744682 -0.4291802
 999: -0.52261670  0.53685602  1.1890118
1000: -0.24919068 -0.46048557  0.8342941
> DT[, c('x', 'y', 'z') := as.list(normalize(c(x, y, z))), by=1:nrow(DT)]                                                                             
> DT
                x           y          z
   1:  0.00000000  0.00000000  0.0000000
   2:  0.00000000  0.00000000  0.0000000
   3:  1.56005167 -0.01799574 -0.5420559
   4:  0.06091117 -0.11418417  1.0532730
   5:  0.00000000  0.00000000  0.0000000
  ---                                   
 996: -0.08588413  0.07315877  1.0127254
 997:  1.21625341  0.28990225 -0.5061557
 998:  0.00000000  0.00000000  0.0000000
 999: -0.43433718  0.44617122  0.9881660
1000: -1.99963905 -3.69518205  6.6948211
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