我如何在R中的第二列订购数据框？
可能重复：
如何按R中的列对数据框进行排序
我只是想知道如果有人能帮助我，我有我认为应该是一个容易解决的问题。
我有下面的表格：
SampleID Cluster
R0132F041p 1
R0132F127 1
R0132F064 1
R0132F068p 1
R0132F015 2
R0132F094 3
R0132F105 1
R0132F013 2
R0132F114 1
R0132F014 2
R0132F039p 3
R0132F137 1
R0132F059 1
R0132F138p 2
R0132F038p 2
我想通过Cluster对它进行排序以获得如下结果：
SampleID Cluster
R0132F041p 1
R0132F127 1
R0132F064 1
R0132F068p 1
R0132F105 1
R0132F114 1
R0132F137 1
R0132F059 1
R0132F015 2
R0132F013 2
R0132F014 2
R0132F138p 2
R0132F038p 2
R0132F094 3
R0132F039p 3
我已经尝试了以下R代码：
data<-read.table('Table.txt', header=TRUE,row.names=1,sep='t')
data <- data.frame(data)
data <- data[order(data$Cluster),]
write.table(data, file = 'OrderedTable.txt', append = TRUE,quote=FALSE, sep = 't', na ='NA', dec = '.', row.names = TRUE, col.names = FALSE)
并获得以下输出：
1 1
2 1
3 1
4 1
5 1
6 1
7 1
8 1
9 2
10 2
11 2
12 2
13 2
14 3
15 3
为什么SampleID被数字1-15取代，这些数字代表了什么，我已经阅读了?order()页面，但是这似乎解释了sort.list比order（）更好，如果有人能帮我解决这个问题的话我会很感激。
简短的答案是你做得很完美。 你只是在阅读和写文件时遇到一些困难。 通过你的代码：
data<-read.table('Table.txt', header=TRUE,row.names=1,sep='t')
上面的行正在读取您的数据，但row.names=1告诉它使用第一列作为行的名称。 所以现在你的SampleIDs是行名，而不是它们自己的列。 如果您在运行此行后立即键入data或head(data)或str(data) ，则应该清楚。 只要省略row.names参数，它就会正确读取。
data <- data.frame(data)
你不需要上面这行，因为read.table()产生一个数据帧。 你也可以用str(data)来看。
data <- data[order(data$Cluster),]
上面的线是完美的。
write.table(data, file = 'OrderedTable.txt', append = TRUE,
quote=FALSE, sep = 't', na ='NA', dec = '.', row.names = TRUE,
col.names = FALSE)
这里你包含了参数col.names = FALSE ，这就是你的文件没有列名的原因。 你也不需要/想要append=TRUE 。 如果你看一下help(write.table) ，你会发现它“只在文件是字符串时才有意义”。 在这里，它似乎使文件写入没有结束最后一行，这可能会导致任何后来read.table()抱怨。
结果中的数字1-15看起来像行号。 你不解释你如何看待最终文件，所以我不能确定。 您可能会以不解析row.names的方式读取文件，而是显示行号。 如果你确定你的SampleIDs列没有被赋值为行的名字，你可能会好起来的。
看看plyr软件包的arrange功能。
arrange(data, Cluster)
write.table(data, "ordered_data.txt")