Spark和HBase快照

假设我们可以从HDFS直接获取数据而不是使用HBase API来更快地访问数据,我们正在尝试基于HBase的Table Snapshot构建RDD。

所以,我有一个叫做“dm_test_snap”的快照。 我似乎能够获得大部分配置工作,但是我的RDD为空(尽管Snapshot中有数据)。

我有一段时间找到了一个人用Spark来对HBase快照进行离线分析的例子,但我无法相信我会一个人努力做到这一点。 任何帮助或建议非常感谢。

这是我的代码片段:

object TestSnap  {
  def main(args: Array[String]) {
    val config = ConfigFactory.load()
    val hbaseRootDir =  config.getString("hbase.rootdir")
    val sparkConf = new SparkConf()
      .setAppName("testnsnap")
      .setMaster(config.getString("spark.app.master"))
      .setJars(SparkContext.jarOfObject(this))
      .set("spark.executor.memory", "2g")
      .set("spark.default.parallelism", "160")

    val sc = new SparkContext(sparkConf)

    println("Creating hbase configuration")
    val conf = HBaseConfiguration.create()

    conf.set("hbase.rootdir", hbaseRootDir)
    conf.set("hbase.zookeeper.quorum",  config.getString("hbase.zookeeper.quorum"))
    conf.set("zookeeper.session.timeout", config.getString("zookeeper.session.timeout"))
    conf.set("hbase.TableSnapshotInputFormat.snapshot.name", "dm_test_snap")

    val scan = new Scan
    val job = Job.getInstance(conf)

    TableSnapshotInputFormat.setInput(job, "dm_test_snap", 
        new Path("hdfs://nameservice1/tmp"))

    val hBaseRDD = sc.newAPIHadoopRDD(conf, classOf[TableSnapshotInputFormat],
      classOf[org.apache.hadoop.hbase.io.ImmutableBytesWritable],
      classOf[org.apache.hadoop.hbase.client.Result])

    hBaseRDD.count()

    System.exit(0)
  }

}

更新以包含解决方案诀窍是,正如@Holden下面提到的那样,conf并没有通过。 为了解决这个问题,我可以通过将这个调用改为newAPIHadoopRDD来实现:

val hBaseRDD = sc.newAPIHadoopRDD(job.getConfiguration, classOf[TableSnapshotInputFormat],
      classOf[org.apache.hadoop.hbase.io.ImmutableBytesWritable],
      classOf[org.apache.hadoop.hbase.client.Result])

还有第二个问题,也是@维克特的答案突出的,我没有通过扫描。 为了解决这个问题,我添加了这一行和方法:

conf.set(TableInputFormat.SCAN, convertScanToString(scan))

 def convertScanToString(scan : Scan) = {
      val proto = ProtobufUtil.toScan(scan);
      Base64.encodeBytes(proto.toByteArray());
    }

这也让我从conf.set命令中拉出这一行:

conf.set("hbase.TableSnapshotInputFormat.snapshot.name", "dm_test_snap")

*注意:这是针对CDH5.0上的HBase 0.96.1.1版本的

最后完整的代码以便于参考:

object TestSnap  {
  def main(args: Array[String]) {
    val config = ConfigFactory.load()
    val hbaseRootDir =  config.getString("hbase.rootdir")
    val sparkConf = new SparkConf()
      .setAppName("testnsnap")
      .setMaster(config.getString("spark.app.master"))
      .setJars(SparkContext.jarOfObject(this))
      .set("spark.executor.memory", "2g")
      .set("spark.default.parallelism", "160")

    val sc = new SparkContext(sparkConf)

    println("Creating hbase configuration")
    val conf = HBaseConfiguration.create()

    conf.set("hbase.rootdir", hbaseRootDir)
    conf.set("hbase.zookeeper.quorum",  config.getString("hbase.zookeeper.quorum"))
    conf.set("zookeeper.session.timeout", config.getString("zookeeper.session.timeout"))
    val scan = new Scan
    conf.set(TableInputFormat.SCAN, convertScanToString(scan))

    val job = Job.getInstance(conf)

    TableSnapshotInputFormat.setInput(job, "dm_test_snap", 
        new Path("hdfs://nameservice1/tmp"))

    val hBaseRDD = sc.newAPIHadoopRDD(job.getConfiguration, classOf[TableSnapshotInputFormat],
      classOf[org.apache.hadoop.hbase.io.ImmutableBytesWritable],
      classOf[org.apache.hadoop.hbase.client.Result])

    hBaseRDD.count()

    System.exit(0)
  }

  def convertScanToString(scan : Scan) = {
      val proto = ProtobufUtil.toScan(scan);
      Base64.encodeBytes(proto.toByteArray());
  }

}

查看作业信息,它将制作你提供给它的conf对象的副本( The Job makes a copy of the Configuration so that any necessary internal modifications do not reflect on the incoming parameter.因此,最有可能的信息是你需要在conf对象上设置不会传递给Spark。 你可以改用TableSnapshotInputFormatImpl ,它有一个类似于conf对象的方法。 可能还需要额外的东西,但首先通过这个问题似乎是最可能的原因。

正如在注释中指出的那样,另一种选择是使用job.getConfiguration从作业对象获取更新的配置。


您尚未正确配置您的M / R作业:这是Java中关于如何配置M / R over snapshots的示例:

Job job = new Job(conf);
Scan scan = new Scan();
TableMapReduceUtil.initTableSnapshotMapperJob(snapshotName,
       scan, MyTableMapper.class, MyMapKeyOutput.class,
       MyMapOutputValueWritable.class, job, true);
}

你肯定跳过了扫描。 我建议你看看TableMapReduceUtil的initTableSnapshotMapperJob实现,以了解如何在Spark / Scala中配置作业。


这是mapreduce Java中的完整配置

TableMapReduceUtil.initTableSnapshotMapperJob(snapshotName, // Name of the snapshot
                scan, // Scan instance to control CF and attribute selection
                DefaultMapper.class, // mapper class
                NullWritable.class, // mapper output key
                Text.class, // mapper output value
                job,
                true,
                restoreDir);
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