无法在Jupyter笔记本中加载IRKernel
我对这个论坛很新,所以如果这个问题已经得到解答,我很抱歉。 我环顾四周,虽然我看到有些人有类似的问题,但我在以前的帖子中找不到解决问题的办法。 所以 - 这里去...
我正在运行Mac OS X 10.11.5,Jupyter笔记本版本4.2.1,R版本3.2.2
我使用以下命令安装了Jupyter笔记本的R内核 -
conda install -c r r-irkernel
现在,当我启动Jupyter笔记本电脑时,我看到'R'是右侧“笔记本”下拉菜单中的一个选项。 但是,当我尝试创建R笔记本时,内核崩溃,并在终端中出现以下错误:
WARNING:root:kernel b42781ab-ebb1-45eb-8a54-d3801106fb94 restarted
Error: .onLoad failed in loadNamespace() for 'pbdZMQ', details:
call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
error: unable to load shared object '/Users/avislova/anaconda/lib/R/library/pbdZMQ/libs/pbdZMQ.so':
dlopen(/Users/avislova/anaconda/lib/R/library/pbdZMQ/libs/pbdZMQ.so, 6): Library not loaded: @rpath/libzmq.5.dylib
Referenced from: /Users/avislova/anaconda/lib/R/library/pbdZMQ/libs/pbdZMQ.so
Reason: image not found
Execution halted
[W 16:19:12.382 NotebookApp] KernelRestarter: restart failed
[W 16:19:12.382 NotebookApp] Kernel b42781ab-ebb1-45eb-8a54-d3801106fb94 died, removing from map.
ERROR:root:kernel b42781ab-ebb1-45eb-8a54-d3801106fb94 restarted failed!
[W 16:19:12.390 NotebookApp] Kernel deleted before session
[W 16:19:12.390 NotebookApp] 410 DELETE /api/sessions/2236e334-e33a-483b-87f3-31c461d4903b (::1) 1.32ms referer=http://localhost:8888/notebooks/Untitled5.ipynb?kernel_name=ir
任何想法我可以从这里去?
谢谢!
我在我的Mac上更新'R'后面临类似的问题。
以下步骤解决了我的问题
install.packages(c('pbdZMQ', 'repr', 'devtools'))
devtools::install_github('IRkernel/IRdisplay')
devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')
IRkernel::installspec()
有关更多详情,请参阅http://johnlaudun.org/20160521-irkernel-difficulties/
我经常发现自己重装系统; 对@JeeZ更进一步,我在'R安装过程'结束时总是在R中运行以下内容:
install.packages(c("knitr", "ggplot2","rpart.plot","devtools","ggvis","psych","dplyr","tidyr","rvest","magrittr","testthat","roxygen2"),dependencies=TRUE)
#--> set Sweave to knitr
install.packages(c('rzmq','repr','IRkernel','IRdisplay', 'pbdZMQ'),
repos = c('http://irkernel.github.io/', getOption('repos')),
type = 'source')
IRkernel::installspec()
在R中安装devtools之后:
> install.packages("devtools")
尝试从github安装以下内容:
> library("devtools")
> devtools::install_github("IRkernel/repr")
> devtools::install_github("IRkernel/IRdisplay")
> devtools::install_github("IRkernel/IRkernel")
最后一行为我安装了pdbZMQ,尽管使用install.packages(“pdbZMQ”)报告说任何版本的RI都不存在。
更多的细节和疑难解答可以在github上找到这个解决方案。
链接地址: http://www.djcxy.com/p/92575.html