重新编译从存储库安装的nginx

我在一个Debian 8上安装了Nginx 1.10.3。
由于我想加载一个新模块，因此我必须下载nginx源代码（仍为1.10.3）并重新编译它，以便生成我需要的my_desired_module.so 。
从repo安装的Nginx是当前正在运行的那个，位于/etc/nginx

我编译的新Nginx位于/usr/local/nginx并且我猜没有运行。
我以为我是个聪明人，只是将新生成的my_desired_module.so复制到我运行的Nginx的/modules-enabled/目录中。 我认为它会工作，因为我从版本1.10.3编译，但它在nginx日志中抛出一个is not binary compatible错误:-)

显然，我不是一个聪明的人，所以我考虑保存我的conf文件，删除当前运行的Nginx（它是从repo安装的），然后运行新编译的nginx。
然而，我不想把bin和sbin和nginx.pid ，因为在我看来，像service nginx restart这样的命令仍然由我从repo安装的nginx处理，而不是由我刚刚编译的nginx处理。

问题：我如何编译它以便我编译的nginx能够通过我从repo安装的nginx？
编译后的nginx的sbin是/usr/local/nginx/sbin/nginx
而当前运行的nginx的sbin是/usr/sbin/nginx

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