f2py与fortran netcdf
我正在尝试使用f2py来编译一些使用netcdf库的fortran代码。 编译似乎工作,但是当我尝试在python中导入模块时,我收到错误消息:
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
ImportError: ./cdfio_simple.so: undefined symbol: netcdf_mp_nf90_get_var_2d_fourbytereal_
编译期间还有以下输出:
In: :cdfio_simple:cdfio_simple.f90:cdfio_simple get_useparameters: no module netcdf info used by cdfio_simple
我试图使用的代码是(注意这是简化的代码来演示问题):
MODULE cdfio_simple USE netcdf PRIVATE PUBLIC getvar CONTAINS FUNCTION getvar (cdfile,cdvar) CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) :: cdfile, & ! file name & cdvar ! variable REAL(KIND=4), DIMENSION(1442,1021) :: getvar ! 2D REAL !! * Local variables INTEGER :: ncid, id_var INTEGER :: istatus CHARACTER(LEN=300) :: clvar !f2py INTENT(in):: cdfile, cdvar clvar=cdvar istatus=NF90_OPEN(cdfile,NF90_NOWRITE,ncid) istatus=NF90_INQUIRE(ncid,unlimitedDimId=id_dimunlim) istatus=NF90_INQ_VARID ( ncid,clvar,id_var) istatus=NF90_GET_VAR(ncid,id_var,getvar) istatus=NF90_CLOSE(ncid) getvar(:,:)=1 END FUNCTION getvar END MODULE cdfio_simple
为了编译它,我使用下面的命令:
f2py --fcompiler=intelem -c -I/usr/local/netcdf/include/ -L/usr/local/netcdf/lib -lnetcdff --f90flags=-fPIC -m cdfio_simple cdfio_simple.f90
有没有人有一个想法如何让这个工作正常? 在此先感谢您的任何建议。
蒂姆
来自编译器的“no module netcdf”错误消息可能表明存在以下任一问题:
在/ usr / local / netcdf / include /中没有安装netcdf.mod模块文件,它应该作为netcdf-fortran软件安装的一部分安装
您正在使用与用于创建安装在该目录中的netcdf.mod模块文件不同的Fortran编译器。 不同的Fortran编译器对二进制.mod文件有不同的格式。